1995年1月1日 县中医院成立，员工13名，房屋设备一无所有，租养护段房屋营业，开设中、西医综合门诊。
1995年 针灸科成立
1996年1月 购入电子肛肠治疗仪，开展了肛肠科手术。
1997年4月 购置土地5.7亩。
1998年7月 1500平方米的门诊综合楼落成，同时完成了住院楼第一层的建设。
1998年8月 在新院址设立第一门诊及住院部，开展了综合住院业务。
2000年7月11日 成功进行了第一例阑尾切除手术。
2000年9月20日 建成放射室并开展放射检查业务。
2001年5月 中医院作为全州城镇医药卫生体制改革试点，公开选拔院长，实行院长竟争上岗，重组了领导班子。
2001年11月 完成了住院大楼续建工程及消毒供应室建设和院子绿化美化工程。
2001年12月 增设住院病床数至50张。
2001年12月 成功安装医院传呼系统。
2001年12月 通过国家中医药管理局二级乙等中医医院评审验收，步入了等级医院管理行列。
2001年12月 团县委授予南涧县中医院住院部“青年文明号”称号。
2001年 人力资源社会保障厅授予中医院为“城镇职工医疗保险定点医疗机构”。
2001年12月25日 全州城镇医药卫生体制改革现场会在南涧召开，副州长杨晏君、州政协副主席李文泰及全州十二个县(市)分管卫生的副县(市)长和卫生局、财政、人事、计委、劳动、药品监督等部门领导150多人参加了会议并来院参观指导。
2002年4月 购入尿液分析仪，开展了尿液11项分析检查。
2003年3月 州发展计划委员会、州卫生局授予南涧县中医院“药品质量和医疗服务价格信得过单位”的称号。
2003年4月 加入云南省中医医疗集团，成为中医医疗集团成员单位。
2003年9月 购入法国ABX血球分析仪，开展21项血液分析。
2004年3月 建成医院局域网，实现了计算机网络化管理。
2004年3月 团州委授予南涧县中医院住院部“青年文明号”称号。
2004年8月 购入半自动生化分析仪，开展血液生化分析。
2005年1月 外科成立，开展了外科住院业务。
2005年1月29日 成功地进行了第一例骨科手术。
2005年2月22日 成功地进行了股骨头置换术。
2005年2月29日 成功进行了第一例胆囊切除手术。
2005年5月 厂院联合建立了体外震波碎石室，开展了泌尿系结石体外震波碎石治疗业务。
2005年12月 撤消养护段综合门诊。
2005年12月 县总工会授予中医院工会委员会“合格职工之家”
2005年12月 县委县人民政府授予中医院“文明单位称号”
2006年4月 县卫生局授予中医院“先进集体称号”
2006年元旦 县劳动和社会保障局授予中医院医疗保险定点医疗机构综合考评第二名
2007年12月 县级机关委员会授予中医院“先进党支部”称号
2008年4月 卫生局授予中医院“先进集体称号”
2008年12月 县委县人民政府授予中医院“文明单位”称号
2008年3月 大理州城镇妇女“巾帼建功”活动领导小组授予中医院“巾帼文明岗”
2009年5月 县委县人民政府授予小湾水电站南涧县移民外迁安置工作“组织奖”
2009年9月 发展和改革局、县委宣传部、文明办授予中医院“价格诚信单位”
2009年12月 发展和改革局、县委宣传部、文明办授予中医院“大理州价格诚信单位”
2011年12月 县委县人民政府授予中医院“文明单位称号”
2012年3月 购置德国进口飞利浦数字化X线摄影系统(DR)、美国进口全自动生化分析仪
2012年至2013年创建二级甲等中医医院并于2013年8月顺利通过评审
2013年3月 全面完善信息系统建设
2013年7月 老年病科成立
2013年7月1日 卫生局授予中医医院“一建党节歌咏比赛三等奖”
2014年 筹备南涧县中医医院整体搬迁工作，争取拟建设南涧县中医医院门诊住院综合楼
2014年7月1日 县卫生局委员会授予中医医院“先进基层党组织”称号
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