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巢元方为隋代太医博士,曾奉敕主持编写医学名著《诸病源候论》。《诸病源候论》宋绶序曰:“《诸病源候论》者,隋大业中太医巢元方等奉诏所作也。”朱彝尊跋《曝书亭集》说隋太医令巢元方在大业年间奉敕“与诸医共论疢疾所起之源及九候之要”。可见,《诸病源候论》是由巢元方奉隋朝朝廷敕令,会同当时的宫廷御医集体编写的著作。
巢元方生卒年不详,隋代大业年间曾任太医博士,后来擢升为太医令,据《开河记》记载,开河都护麻叔谋在宁陵(今属河南)久患风逆,瘫痪在床,帝敕太医令巢元方前往探视,巢元方为其治愈,由此可见巢氏临床水平之高。
《诸病源候论》成书于大业六年(公元610年),又名《巢氏病源》,简称《病源》,全书共五十卷,分为六十七门,论述病源证候一千七百三十九论。该书内容丰富,总结了魏晋以来、隋代以前的医疗经验。它将诸病之源与九候之要进行了细致的论述,主要说明各科疾病的病因和证候、症状,包括了诊断和预后,每个疾病之后,大多附有“补养宣导”的具体方法,说明本书对“补养宣导”的重视。《诸病源候论》从临床医学的角度出发,较为全面地论述了各种证候的病理机制,并分析了症状,探索了病因。其说理清楚,“意到而辞畅”,论理常常本诸《内经》,亦有采撷仲景及其他前人之说,再结合临床实际发病谨向周密而切实的阐发,从而构成了一部临床病理学和证候学方面的不朽专著。该书对疾病的记载广泛而详确,其收载的疾病病种包括了内、外、妇、儿、五官科等,其中以内科疾病占绝大多数。
《诸病源候论》对于病源的认识,除根据传统的医学理论进行解释之外,还根据临床经验,进行了新的理论探索。如“瘟病候”中,认为某些传染病,是由外界物质致病因素“乖戾之气”所引起的,乖戾之气还能“多相染易”,但是可以服用药物预防,这对后世温病学的发展有一定影响。对一些病源的认识,是切实符合临床实际的。