值得一提的是，藏医学中的胚胎学，藏医在这方面有着辉煌的历史，也有很多成就。
藏医认为，胎儿是由父亲的精与母亲的血二者结合而成的，不论是父精，或是母血，只要一方有病，如隆、赤巴、培根有病，就无法受孕，如精或血的外观粗糙，颜色、粘稠度异常，气味不正等，都不会受孕怀胎。在没有显微镜足以观察到细如精子或卵子的结构时，这种描述不仅是自然可取的，而且具有十分重要的意义。因为在旧社会，总是把不孕的责任全归咎于妇女，而藏医却明确提出男女双方有着同样责任，这是完全符合科学道理的。
藏医还指出，胎儿的形成，还需要正常的"五源"条件。所谓"五源"，是指土、水、火、风、空。无独有偶，汉族中医也认为，胎儿形成后，逐渐发育，"四月而水受之，五月而火受之，六月而金受之，七月而木受之，八月而土受之"，二者不谋而合，只是藏医的"五源"与中医的"五行"稍有不同，中医的土，是发育的土地，而藏医的"空"，是胎儿发育的空间，意义上都相差不远，也都认为，这五种必须同时具备，缺一不可，而且五者应互相协调，胎儿才能正常发育。
中国有句古话，叫"十月怀胎，一朝分娩"。中医对胎儿发育的认识，也都以十个月为准，逐月叙述胎儿发育的情况，如南北朝时期的《逐月养胎方》就有"妊娠一月始胚，二月始膏，三月始胞，四月形体成，五月能动，六月筋骨立，七月毛发生，八月腑腑具，九月谷气入胃，十月诸神备，日满即产矣"的记述，用以观察描述胎儿的发育。对此，藏医的认识则更为细致而深入，它是以周日的时间为单位来认识和观察人体胎儿发育过程的，胎儿从形成到成熟分娩，需要38周的时间。
藏医对胚胎学的认识，在古代各国医学中，可以说是首屈一指的，从历史的观点看，更有其先进性。
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